Een volwassen Amazonemuggenvanger wordt 10 tot 12cm groot. Zijn jizz is vergelijkbaar met die van andere muggenvangers; een kleine vogel met een relatief lange dunne snavel, een lange vaak gespannen staart, grijze bovendelen en witachtige onderzijde. De centrale staartveren zijn zwart, terwijl de buitenste wit zijn, en er is een witte vlek in de vleugel (veroorzaakt door brede witte randen aan de tertials). Mannetjes van de nominaat vorm hebben een contrasterende zwarte pet die net tot onder het oog reikt, terwijl deze ontbreekt bij vrouwtjes, die in plaats daarvan een grijze pet hebben (dezelfde kleur als de achterkant).